ある日、小学4年生のエイミー・アン・オリンジャーは、お気に入りの『クローディアの秘密』が、図書室の棚から消えたことに気づく。「子どもにふさわしくない本」として、貸出禁止なったのだ。エイミー・アンは友だちの助けを借りながら行動を起こし始め…。